Вернуться к: Биохимия
Здесь можно повертеть дипептид и посмотреть на стерические столкновения.
Ниже галерея с разными иллюстрациями по альфа-спирали:
А вот по бета-складчатому слою:
Супервторичная структура
Название просто ужасное — оно указывает на то, что эта структура выше вторичной, но на самом деле это не так. На западе используют другое — структурные мотивы или паттерны. Структурные мотивы это повторяющиеся участки, которые встречаются в разных белках.
Наиболее частые из них: бета-тяж + альфа-спираль + бета-тяж (бета-альфа-бета петля); альфа-спираль + бета-поворот + альфа-спираль; бета-бочонок.
Всё-таки белков слишком много. Каждый из них не может быть совсем не похож на остальные. Например, у наших клеток есть порины — белки для транспорта разных веществ. В основном небольших ионов и воды. В поринах есть «супервторичная структура» — бета-бочонок. Бета-бочонок образует кольцо, которое встраивается в мембрану. Свободное пространство внутри кольца используется для транспорта веществ.
Все порины имеют общий паттерн, но каждый из них уникален. Один будет транспортировать ионы натрия, а другой калия. Всё благодаря внутренней поверхности кольца — туда будут торчать радикалы. Радикалы пропускают один ион, но не пропускают другой, создавая уникальность внутренней поверхности кольца.
Наличие структурных мотивов не значит, что все белки одинаковы. Они просто чем-то похожи друг на друга. В особенности те, которые выполняют примерно одинаковые функции. Белки можно сравнить с людьми — мы тоже похожи, но двух одинаковых человеков не существует.